Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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DDX39BQ13838 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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DDX39BQ13838 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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DDX39BQ13838 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
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DDX39BQ13838 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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