Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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