Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms