Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
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TRAF1Q13077 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
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TRAF1Q13077 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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TRAF1Q13077 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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TRAF1Q13077 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
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TRAF1Q13077 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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TRAF1Q13077 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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TRAF1Q13077 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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