Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
STRN3Q13033 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.4 ms