Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PRDM2Q13029 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.5 ms