Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms