Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB40BQ12829 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB40BQ12829 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB40BQ12829 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB40BQ12829 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB40BQ12829 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB40BQ12829 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB40BQ12829 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB40BQ12829 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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RAB40BQ12829 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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RAB40BQ12829 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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RAB40BQ12829 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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RAB40BQ12829 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RAB40BQ12829 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RAB40BQ12829 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RAB40BQ12829 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RAB40BQ12829 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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RAB40BQ12829 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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RAB40BQ12829 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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RAB40BQ12829 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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RAB40BQ12829 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
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RAB40BQ12829 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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RAB40BQ12829 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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RAB40BQ12829 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RAB40BQ12829 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RAB40BQ12829 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RAB40BQ12829 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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RAB40BQ12829 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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RAB40BQ12829 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RAB40BQ12829 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RAB40BQ12829 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RAB40BQ12829 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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