Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NUP160Q12769 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms