Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
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PTPRBP23467 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
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PTPRBP23467 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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PTPRBP23467 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
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PTPRBP23467 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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PTPRBP23467 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
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PTPRBP23467 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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