Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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ANKRD28O15084 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28O15084 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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