Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms