Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SRRTQ9BXP5 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms