Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CITED1Q99966 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CITED1Q99966 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CITED1Q99966 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CITED1Q99966 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CITED1Q99966 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CITED1Q99966 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CITED1Q99966 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CITED1Q99966 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CITED1Q99966 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CITED1Q99966 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CITED1Q99966 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CITED1Q99966 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CITED1Q99966 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CITED1Q99966 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms