Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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