Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

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Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC1□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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CFAP47Q6ZTR5 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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CFAP47Q6ZTR5 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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CFAP47Q6ZTR5 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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CFAP47Q6ZTR5 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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CFAP47Q6ZTR5 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
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CFAP47Q6ZTR5 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CFAP47Q6ZTR5 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.97□□□□□ -2.25
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