Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms