Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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