Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms