Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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