Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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