Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NCAPHQ15003 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NCAPHQ15003 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NCAPHQ15003 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NCAPHQ15003 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NCAPHQ15003 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NCAPHQ15003 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NCAPHQ15003 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NCAPHQ15003 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NCAPHQ15003 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
NCAPHQ15003 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
NCAPHQ15003 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NCAPHQ15003 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms