Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
BECN1Q14457 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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