Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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COL9A3Q14050 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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