Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCINQ13939 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCINQ13939 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCINQ13939 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCINQ13939 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCINQ13939 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCINQ13939 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCINQ13939 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCINQ13939 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCINQ13939 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCINQ13939 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCINQ13939 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCINQ13939 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCINQ13939 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCINQ13939 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCINQ13939 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCINQ13939 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCINQ13939 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCINQ13939 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCINQ13939 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCINQ13939 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCINQ13939 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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CCINQ13939 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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CCINQ13939 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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CCINQ13939 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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CCINQ13939 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCINQ13939 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCINQ13939 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCINQ13939 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCINQ13939 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCINQ13939 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCINQ13939 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCINQ13939 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCINQ13939 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
CCINQ13939 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CCINQ13939 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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