Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRQ13535 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRQ13535 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRQ13535 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRQ13535 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRQ13535 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRQ13535 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRQ13535 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRQ13535 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRQ13535 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRQ13535 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRQ13535 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRQ13535 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRQ13535 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRQ13535 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRQ13535 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRQ13535 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRQ13535 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRQ13535 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRQ13535 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRQ13535 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRQ13535 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRQ13535 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRQ13535 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRQ13535 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRQ13535 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRQ13535 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRQ13535 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRQ13535 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRQ13535 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRQ13535 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRQ13535 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRQ13535 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
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