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| PTK7 | Q13308 | ANO6-205 | ENST00000441606 | 5955 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | C5orf42-201 | ENST00000425232 | 11199 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | LST1-207 | ENST00000376092 | 285 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.489-201 | ENST00000384410 | 101 nt | BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | MT-TR-201 | ENST00000387439 | 65 nt | BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | EHBP1-202 | ENST00000405015 | 4108 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR1252-201 | ENST00000408861 | 65 nt | BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU2-3P-201 | ENST00000410144 | 191 nt | BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL158071.1-201 | ENST00000430315 | 461 nt | BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
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| PTK7 | Q13308 | MYBPC1-206 | ENST00000541119 | 3533 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL157871.3-201 | ENST00000557231 | 293 nt | BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
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| PTK7 | Q13308 | LINC01566-202 | ENST00000569242 | 2801 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
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| PTK7 | Q13308 | FAM107B-229 | ENST00000622567 | 3510 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | KCNJ16-204 | ENST00000585558 | 4014 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL450345.1-202 | ENST00000605741 | 3881 nt | BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | NUP155-202 | ENST00000381843 | 4200 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.43 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | FAT3-201 | ENST00000409404 | 19030 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.43 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC008669.1-201 | ENST00000565823 | 2178 nt | BASIC | 5.43 | □□□□□ -1.54 | | |
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| PTK7 | Q13308 | ELAVL4-203 | ENST00000371821 | 3349 nt | TSL 5 BASIC | 5.43 | □□□□□ -1.54 | | |
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| PTK7 | Q13308 | OR8J2-201 | ENST00000641465 | 2883 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.43 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC092329.3-201 | ENST00000611392 | 1904 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.43 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | MEG8-223 | ENST00000638012 | 3757 nt | TSL 5 BASIC | 5.43 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | DAZ1-205 | ENST00000540248 | 3268 nt | TSL 5 BASIC | 5.43 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | PCDH15-201 | ENST00000320301 | 6845 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.43 | □□□□□ -1.54 | | |
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| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.210-201 | ENST00000364161 | 110 nt | BASIC | 5.43 | □□□□□ -1.54 | | |
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| PTK7 | Q13308 | AC114755.2-201 | ENST00000413520 | 361 nt | BASIC | 5.43 | □□□□□ -1.54 | | |
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| PTK7 | Q13308 | AC022335.1-204 | ENST00000590779 | 600 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 5.43 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC019206.1-201 | ENST00000621938 | 425 nt | BASIC | 5.43 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | FP236240.3-201 | ENST00000623061 | 327 nt | BASIC | 5.43 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | CCDC25-212 | ENST00000640944 | 261 nt | TSL 5 BASIC | 5.43 | □□□□□ -1.54 | | |
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| PTK7 | Q13308 | ZNF525-202 | ENST00000474037 | 3890 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.43 | □□□□□ -1.54 | | |
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| PTK7 | Q13308 | OR5AU1-203 | ENST00000641697 | 7755 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.43 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC104623.2-202 | ENST00000623477 | 4002 nt | BASIC | 5.43 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | ZNF704-201 | ENST00000327835 | 14386 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.43 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | DEUP1-202 | ENST00000525646 | 1920 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.42 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | OR2AT4-205 | ENST00000641931 | 8357 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.42 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | AGO3-203 | ENST00000373191 | 19687 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.42 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | ABI3BP-215 | ENST00000495063 | 3714 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.42 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | TNRC6B-206 | ENST00000454349 | 18279 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 5.42 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | NRG1-220 | ENST00000539990 | 2401 nt | TSL 2 BASIC | 5.42 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | LRRC19-201 | ENST00000380055 | 3609 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.42 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-784P-201 | ENST00000384330 | 106 nt | BASIC | 5.42 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.526-201 | ENST00000384572 | 110 nt | BASIC | 5.42 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | TRAV7-201 | ENST00000390429 | 337 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.42 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL035079.1-201 | ENST00000405210 | 287 nt | BASIC | 5.42 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL138885.1-201 | ENST00000405921 | 675 nt | BASIC | 5.42 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-325P-201 | ENST00000411132 | 105 nt | BASIC | 5.42 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL592078.1-201 | ENST00000421866 | 321 nt | TSL 3 BASIC | 5.42 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | LINC01204-201 | ENST00000422047 | 639 nt | TSL 3 BASIC | 5.42 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL450023.3-201 | ENST00000440592 | 271 nt | BASIC | 5.42 | □□□□□ -1.54 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC073587.1-201 | ENST00000447093 | 876 nt | BASIC | 5.42 | □□□□□ -1.54 | | |