Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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