Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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CALCOCO2Q13137 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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CALCOCO2Q13137 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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