Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
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