Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms