Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms