Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIN2AQ12879 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms