Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC0.78□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms