Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
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PGGT1BP53609 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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PGGT1BP53609 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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PGGT1BP53609 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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