Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
J3KRW8 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
J3KRW8 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.2 ms