Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.4 ms