Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GDAP2Q9NXN4 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.6 ms