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| HOXD1 | Q9GZZ0 | LINC01828-202 | ENST00000450294 | 955 nt | TSL 5 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| HOXD1 | Q9GZZ0 | TBL1XR1-AS1-201 | ENST00000454723 | 414 nt | TSL 5 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| HOXD1 | Q9GZZ0 | AC093110.1-201 | ENST00000456363 | 602 nt | TSL 2 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| HOXD1 | Q9GZZ0 | snoU13.4-201 | ENST00000458916 | 104 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| HOXD1 | Q9GZZ0 | SNORD42A-201 | ENST00000459584 | 64 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
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| HOXD1 | Q9GZZ0 | AF165147.1-201 | ENST00000433310 | 6103 nt | TSL 2 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| HOXD1 | Q9GZZ0 | RICTOR-201 | ENST00000296782 | 7505 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| HOXD1 | Q9GZZ0 | ZNF334-205 | ENST00000615481 | 3706 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| HOXD1 | Q9GZZ0 | TIMM9-202 | ENST00000395159 | 1336 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| HOXD1 | Q9GZZ0 | AC005550.3-201 | ENST00000451240 | 3743 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| HOXD1 | Q9GZZ0 | PPIP5K2-203 | ENST00000414217 | 5842 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
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| HOXD1 | Q9GZZ0 | RNU6-195P-201 | ENST00000411352 | 109 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| HOXD1 | Q9GZZ0 | AC105271.1-202 | ENST00000411417 | 445 nt | TSL 3 BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| HOXD1 | Q9GZZ0 | AC114763.2-201 | ENST00000412593 | 826 nt | TSL 2 BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| HOXD1 | Q9GZZ0 | AC002456.1-201 | ENST00000415965 | 317 nt | TSL 5 BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| HOXD1 | Q9GZZ0 | DUTP6-201 | ENST00000425573 | 462 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| HOXD1 | Q9GZZ0 | AL589872.1-201 | ENST00000426602 | 288 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| HOXD1 | Q9GZZ0 | AL138775.1-201 | ENST00000429539 | 575 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| HOXD1 | Q9GZZ0 | AL731563.2-201 | ENST00000431293 | 291 nt | TSL 5 BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
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| HOXD1 | Q9GZZ0 | OR56A5-202 | ENST00000532411 | 942 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
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| HOXD1 | Q9GZZ0 | MTND1P15-201 | ENST00000579262 | 949 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
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| HOXD1 | Q9GZZ0 | SMAD5-AS1_2.1-201 | ENST00000617906 | 131 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| HOXD1 | Q9GZZ0 | AC009268.2-201 | ENST00000621925 | 457 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| HOXD1 | Q9GZZ0 | AC091953.2-201 | ENST00000623979 | 160 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| HOXD1 | Q9GZZ0 | MIR6733-201 | ENST00000635723 | 61 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| HOXD1 | Q9GZZ0 | PIGX-211 | ENST00000639474 | 777 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| HOXD1 | Q9GZZ0 | CCDC82-201 | ENST00000278520 | 2941 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| HOXD1 | Q9GZZ0 | CCDC178-204 | ENST00000403303 | 3354 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| HOXD1 | Q9GZZ0 | GABRG2-215 | ENST00000639213 | 9960 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| HOXD1 | Q9GZZ0 | C1orf141-202 | ENST00000371006 | 2053 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| HOXD1 | Q9GZZ0 | SERPINI2-209 | ENST00000616363 | 1769 nt | TSL 5 BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| HOXD1 | Q9GZZ0 | CDK1-202 | ENST00000373809 | 1613 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| HOXD1 | Q9GZZ0 | AC092435.3-201 | ENST00000565538 | 3654 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
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| HOXD1 | Q9GZZ0 | AC009975.2-201 | ENST00000635306 | 1429 nt | TSL 5 BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| HOXD1 | Q9GZZ0 | OR1S2-201 | ENST00000302592 | 978 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| HOXD1 | Q9GZZ0 | RNA5SP72-201 | ENST00000364442 | 117 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| HOXD1 | Q9GZZ0 | RNY4P34-201 | ENST00000364779 | 95 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |