Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
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HOXD1Q9GZZ0 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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HOXD1Q9GZZ0 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
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HOXD1Q9GZZ0 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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HOXD1Q9GZZ0 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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HOXD1Q9GZZ0 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
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HOXD1Q9GZZ0 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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