Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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