Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SLC46A3Q7Z3Q1 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SLC46A3Q7Z3Q1 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.6 ms