Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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C9orf135Q5VTT2 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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C9orf135Q5VTT2 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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C9orf135Q5VTT2 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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C9orf135Q5VTT2 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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C9orf135Q5VTT2 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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C9orf135Q5VTT2 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
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C9orf135Q5VTT2 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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C9orf135Q5VTT2 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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