Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms