Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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