Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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