Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms