Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms