Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SSX1Q16384 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SSX1Q16384 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SSX1Q16384 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SSX1Q16384 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SSX1Q16384 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SSX1Q16384 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SSX1Q16384 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
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SSX1Q16384 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SSX1Q16384 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SSX1Q16384 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SSX1Q16384 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SSX1Q16384 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SSX1Q16384 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SSX1Q16384 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SSX1Q16384 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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SSX1Q16384 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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SSX1Q16384 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SSX1Q16384 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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SSX1Q16384 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SSX1Q16384 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SSX1Q16384 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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SSX1Q16384 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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SSX1Q16384 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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SSX1Q16384 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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SSX1Q16384 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SSX1Q16384 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SSX1Q16384 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SSX1Q16384 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
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SSX1Q16384 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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SSX1Q16384 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SSX1Q16384 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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SSX1Q16384 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SSX1Q16384 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SSX1Q16384 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SSX1Q16384 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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