Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
USF2Q15853 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USF2Q15853 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
USF2Q15853 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
USF2Q15853 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USF2Q15853 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USF2Q15853 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
USF2Q15853 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
USF2Q15853 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USF2Q15853 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
USF2Q15853 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
USF2Q15853 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USF2Q15853 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USF2Q15853 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USF2Q15853 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
USF2Q15853 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USF2Q15853 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
USF2Q15853 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USF2Q15853 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
USF2Q15853 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
USF2Q15853 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USF2Q15853 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USF2Q15853 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
USF2Q15853 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
USF2Q15853 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USF2Q15853 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USF2Q15853 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USF2Q15853 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
USF2Q15853 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
USF2Q15853 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USF2Q15853 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USF2Q15853 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
USF2Q15853 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USF2Q15853 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USF2Q15853 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USF2Q15853 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USF2Q15853 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USF2Q15853 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.2 ms