Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TLR1Q15399 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms